Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ARHGEF9-225ENST00000636276 4097 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 AL590004.4-201ENST00000566733 7060 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 SERPINA1-206ENST00000437397 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 FBXO30-201ENST00000237281 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 PTPRA-204ENST00000380393 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 SLC17A2-202ENST00000360488 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 ZNF649-207ENST00000600738 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 KCNMA1-273ENST00000639913 12071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 PKD1L1-201ENST00000289672 9092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 CTAGE5-205ENST00000348007 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 AL133384.2-201ENST00000623755 2954 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 BTN2A2-202ENST00000356709 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 ACTBP13-201ENST00000423971 3959 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 GNL3L-202ENST00000360845 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 LCP2-210ENST00000628092 2421 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
FOXC1Q12948 CUL4B-201ENST00000336592 3109 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 FAM126A-202ENST00000409923 3130 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RNF185-203ENST00000426256 3315 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 TNIK-203ENST00000357327 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 ODF2-209ENST00000434106 3890 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC124319.2-201ENST00000575034 3651 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RBFOX1-201ENST00000311745 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 ZNF778-207ENST00000620195 11031 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RNA5SP79-201ENST00000365193 109 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AL353151.1-201ENST00000402406 604 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RN7SL74P-201ENST00000464966 299 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 ZBTB20-AS4-201ENST00000472323 675 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RN7SL418P-201ENST00000473031 287 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 MRPL40P1-201ENST00000542687 604 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 OR4N1P-201ENST00000554847 949 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC010333.1-201ENST00000563116 563 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC087565.1-201ENST00000565061 391 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 FP565260.7-201ENST00000623998 3634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 URM1-202ENST00000372850 3045 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC114480.1-201ENST00000465933 2919 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 PRDM11-206ENST00000622142 10730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 TRIM55-204ENST00000353317 2624 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 PIK3R1-202ENST00000336483 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 LINC01940-201ENST00000455228 3489 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 COL10A1-201ENST00000243222 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 HSPD1P4-201ENST00000547203 1702 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 GPX6-204ENST00000612264 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 TDP1-202ENST00000393452 2370 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 CD44-206ENST00000415148 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 CACNB2-205ENST00000377319 3116 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 SERPINA9-203ENST00000380365 1333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms