Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TMPOP42166 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TMPOP42166 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TMPOP42166 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TMPOP42166 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TMPOP42166 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TMPOP42166 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TMPOP42166 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TMPOP42166 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TMPOP42166 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
TMPOP42166 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
TMPOP42166 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
TMPOP42166 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
TMPOP42166 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
TMPOP42166 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
TMPOP42166 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TMPOP42166 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms