Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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