Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTF1AQ7RTS3 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTF1AQ7RTS3 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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