Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
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TCIRG1Q13488 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
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TCIRG1Q13488 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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TCIRG1Q13488 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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TCIRG1Q13488 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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TCIRG1Q13488 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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