Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC022639.1-202ENST00000524360 581 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC022898.1-202ENST00000560864 806 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MIR6726-201ENST00000613751 61 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CR391992.1-201ENST00000438601 394 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 HGF-206ENST00000444829 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RPL5P15-201ENST00000475870 897 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC083973.1-201ENST00000523459 590 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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