Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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PTP4A2Q12974 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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