Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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