Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms