Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 OR2A1-202ENST00000641044 4632 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 REG1CP-205ENST00000444841 1710 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AL133464.1-201ENST00000635130 1705 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 TRPM3-204ENST00000360823 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 NDUFS1-204ENST00000440274 2394 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 LINC01132-201ENST00000437601 3793 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AL139327.1-201ENST00000382988 348 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 MIR555-201ENST00000384987 96 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC004986.1-201ENST00000414855 607 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 MED15P9-201ENST00000424716 533 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 PTCSC2-201ENST00000430058 204 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 FDPSP8-201ENST00000438304 1089 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 TDRG1-202ENST00000448433 1015 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 ZNF695-204ENST00000487338 826 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 LINC02024-202ENST00000493545 483 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC012560.1-203ENST00000510550 595 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 TPT1-AS1-214ENST00000521507 665 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 TIMM9-205ENST00000555404 430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 DNM1P31-201ENST00000564149 696 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AL096855.2-201ENST00000605785 369 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC069499.2-201ENST00000610665 382 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 MIR6726-201ENST00000613751 61 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 CCR3-202ENST00000395940 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AL136298.2-201ENST00000556497 1570 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 STOM-201ENST00000286713 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 SGK1-223ENST00000528577 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 ACTR6-202ENST00000546902 1877 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 MEF2C-222ENST00000514028 3393 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 TMX2-201ENST00000278422 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 TPD52-202ENST00000379097 2563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 THAP12P7-201ENST00000520248 2290 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 TFDP2-224ENST00000499676 9335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 SETD7-207ENST00000608958 5281 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 IL12B-201ENST00000231228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 ZNF385B-202ENST00000409343 2750 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC087045.3-201ENST00000623046 2468 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC023055.1-201ENST00000546837 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 ZNF200-203ENST00000396871 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 MTFR2-205ENST00000451457 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 CASP14-201ENST00000427043 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 TTC39B-206ENST00000507285 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 SOCS5P5-201ENST00000402732 1586 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 OR8G1-202ENST00000641972 5055 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 ACACB-203ENST00000377854 6588 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 ZSCAN9-207ENST00000531979 1601 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 IYD-205ENST00000392256 882 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 RPSAP72-201ENST00000407020 358 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC017104.2-201ENST00000417000 321 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC109638.1-201ENST00000417406 326 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 FTH1P5-201ENST00000425761 545 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 WWC3-AS1-201ENST00000430057 578 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 LINC00578-202ENST00000442937 612 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 CMAHP-203ENST00000458373 1101 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL282P-201ENST00000479676 297 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 LSAMP-AS1-201ENST00000490351 553 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC106774.2-201ENST00000510266 406 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC233724.10-201ENST00000510454 409 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC021755.3-201ENST00000560376 864 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 OAZ3-211ENST00000639906 708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TRIM35Q9UPQ4 LINC00960-202ENST00000492922 2126 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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