Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms