Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B8

RASGEF1A, Ras-GEF domain-containing family member 1A, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1AQ8N9B8 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RASGEF1AQ8N9B8 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms