Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms