Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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VPS72Q15906 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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VPS72Q15906 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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VPS72Q15906 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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VPS72Q15906 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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VPS72Q15906 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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