Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.2 ms