Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 FAM155A-IT1-201ENST00000449551 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms