Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 BTN3A2-205ENST00000508906 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 VWC2L-IT1-201ENST00000416430 467 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 PRICKLE2-AS2-201ENST00000484703 496 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC122688.2-201ENST00000543922 585 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms