Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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