Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NPRL3Q12980 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms