Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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FOXF1Q12946 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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FOXF1Q12946 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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FOXF1Q12946 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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FOXF1Q12946 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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FOXF1Q12946 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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FOXF1Q12946 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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FOXF1Q12946 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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