Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SRSF4Q08170 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms