Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NMBRP28336 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NMBRP28336 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NMBRP28336 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NMBRP28336 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NMBRP28336 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NMBRP28336 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms