Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AP002991.2-201ENST00000623807 2801 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRGP23470 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
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