Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 TIAM2-208ENST00000461783 6981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SCN11AQ9UI33 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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