Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 HSD11B1-202ENST00000367027 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CPB2-AS1-204ENST00000606991 3218 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SLC17A3-203ENST00000361703 1543 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 PRAC1-201ENST00000290294 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-21P-201ENST00000363327 163 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 TRBV5-3-201ENST00000390362 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01704-201ENST00000414848 834 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MYB-206ENST00000420123 1051 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 GGT3P-203ENST00000445651 368 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RPL22-208ENST00000497965 786 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC111198.1-201ENST00000505575 606 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC107385.1-201ENST00000507985 778 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 DNM1P34-202ENST00000567850 315 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 OR7A18P-201ENST00000600416 277 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 VDAC1P8-210ENST00000610068 1251 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RHOXF1P2-201ENST00000635431 502 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC018793.5-201ENST00000640302 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 GMFB-209ENST00000616146 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL022334.1-201ENST00000417397 1726 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RNF14-203ENST00000394514 2905 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 IAPP-205ENST00000542023 2015 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 OR4P4-202ENST00000641760 2086 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC150-201ENST00000389175 3685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CRBN-203ENST00000432408 2203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC106882.1-201ENST00000515789 2371 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK10-319ENST00000641459 2542 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 FHL1-204ENST00000370683 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHS1-202ENST00000361048 3249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHS1-207ENST00000619563 3247 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 OR4D6-201ENST00000300127 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SMCP-201ENST00000368765 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 EIPR1-IT1-201ENST00000454977 718 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms