Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TDRD1Q9BXT4 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms