Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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SEMA4DQ92854 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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SEMA4DQ92854 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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SEMA4DQ92854 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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SEMA4DQ92854 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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SEMA4DQ92854 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4DQ92854 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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