Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCF23Q7RTU1 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms