Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LETM2Q2VYF4 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms