Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC96Q2M329 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
CCDC96Q2M329 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
CCDC96Q2M329 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
CCDC96Q2M329 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
CCDC96Q2M329 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CCDC96Q2M329 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
CCDC96Q2M329 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CCDC96Q2M329 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CCDC96Q2M329 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC96Q2M329 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC96Q2M329 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC96Q2M329 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC96Q2M329 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC96Q2M329 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC96Q2M329 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC96Q2M329 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC96Q2M329 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC96Q2M329 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC96Q2M329 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC96Q2M329 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC96Q2M329 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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