Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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CNGB1Q14028 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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CNGB1Q14028 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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CNGB1Q14028 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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CNGB1Q14028 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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