Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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CHAF1AQ13111 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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CHAF1AQ13111 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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CHAF1AQ13111 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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CHAF1AQ13111 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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CHAF1AQ13111 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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