Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
DSC2Q02487 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
DSC2Q02487 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
DSC2Q02487 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
DSC2Q02487 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
DSC2Q02487 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
DSC2Q02487 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
DSC2Q02487 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
DSC2Q02487 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
DSC2Q02487 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
DSC2Q02487 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
DSC2Q02487 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
DSC2Q02487 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
DSC2Q02487 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
DSC2Q02487 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
DSC2Q02487 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
DSC2Q02487 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
DSC2Q02487 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
DSC2Q02487 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms