Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
C4orf47A7E2U8 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
C4orf47A7E2U8 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms