Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 EVI2A-203ENST00000462804 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 CES5AP1-201ENST00000400418 859 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AL773545.3-201ENST00000414297 706 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC008937.2-201ENST00000415589 619 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AL136982.6-201ENST00000444180 1238 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 C15orf40-202ENST00000451195 518 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 OR7E87P-201ENST00000532397 929 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC115676.1-201ENST00000538416 329 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC137767.1-202ENST00000543072 752 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 LINC00469-203ENST00000579749 583 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 APOC2-204ENST00000591597 447 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC093063.1-201ENST00000599317 363 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AP004247.4-201ENST00000608484 942 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 SPINK6-203ENST00000621437 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC079178.2-201ENST00000439323 1624 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 CSNK2A3-201ENST00000528848 1416 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 BDNF-209ENST00000420794 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AL357556.1-201ENST00000421884 1388 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP378-201ENST00000363646 120 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RIT1-201ENST00000368322 855 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP168-201ENST00000410910 300 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 CLEC1A-203ENST00000420265 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 TBX18-AS1-201ENST00000423086 421 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 FUNDC2P2-202ENST00000443452 493 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 DBIL5P-202ENST00000453414 250 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.2 ms