Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TM6SF1Q9BZW5 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TM6SF1Q9BZW5 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms