Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms