Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD40Q6AI12 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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