Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 NPY5R-201ENST00000338566 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 PPWD1-215ENST00000538977 2055 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RPL29-201ENST00000294189 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 DEFB124-201ENST00000317676 216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL3-203ENST00000332628 1035 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MUC1-206ENST00000368390 804 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MUC1-209ENST00000368396 516 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MUC1-210ENST00000368398 729 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL3-218ENST00000372372 1242 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MIR941-2-201ENST00000401322 72 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MIR941-4-201ENST00000401376 72 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 PPIAP2-201ENST00000414143 492 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 FAM180A-202ENST00000415751 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC004448.4-209ENST00000421796 684 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AF130417.1-201ENST00000432412 478 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL022313.3-201ENST00000433970 405 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 KDM4A-AS1-203ENST00000434346 833 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL096701.1-201ENST00000445477 457 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL138930.1-201ENST00000446952 635 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL031597.1-201ENST00000447383 432 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC073089.1-201ENST00000457546 214 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RN7SL749P-201ENST00000460421 290 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RN7SL607P-201ENST00000461220 299 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 FCRL2-205ENST00000469986 902 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RPL7AP26-201ENST00000488538 813 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL627309.2-201ENST00000493797 323 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CCDC58-206ENST00000497726 438 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LINC02058-201ENST00000507491 707 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC026700.1-201ENST00000512074 544 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC092435.1-201ENST00000513711 443 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 DCSTAMP-203ENST00000517991 949 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 TATDN3-207ENST00000526641 1073 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CHURC1-202ENST00000548752 439 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC090502.1-203ENST00000551726 554 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LINC02314-201ENST00000555725 516 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LINC01227-202ENST00000561719 755 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 FRG2DP-201ENST00000564452 852 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 FRG2KP-201ENST00000565692 971 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RN7SL663P-201ENST00000578592 299 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC010761.3-201ENST00000578819 499 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC005387.1-201ENST00000597837 352 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 HNRNPA1P52-201ENST00000599047 947 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC136475.8-201ENST00000602809 386 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MARK3P1-201ENST00000604796 643 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LINC00623-202ENST00000614062 830 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL049794.1-201ENST00000616572 774 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC025162.2-201ENST00000619602 560 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MIR941-5-201ENST00000621667 72 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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