Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
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COL24A1Q17RW2 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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COL24A1Q17RW2 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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COL24A1Q17RW2 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 UTY-214ENST00000617789 6682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 NDUFA9-201ENST00000266544 8363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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