Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC100849.2-201ENST00000518324 519 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC024901.1-201ENST00000535764 718 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL161725.1-210ENST00000590240 1224 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC097717.1-251ENST00000608419 183 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC017037.4-201ENST00000624526 826 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 CCNT1-206ENST00000640148 596 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC119674.1-209ENST00000642031 997 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 OR5E1P-201ENST00000305754 927 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ETFRF1-201ENST00000381356 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RPL23AP7-201ENST00000391616 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 IYD-207ENST00000425615 684 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 KCNQ5-AS1-201ENST00000429832 1101 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 PRSS48-201ENST00000441586 560 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RPL22L1-202ENST00000463836 506 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AP001803.1-201ENST00000525668 147 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 THSD4-AS1-204ENST00000566268 468 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 DSG1-AS1-204ENST00000581856 669 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL591686.2-201ENST00000608241 475 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 EEF1A1P2-201ENST00000553854 1447 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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