Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 SUPT4H1-207ENST00000581540 668 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms