Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms