Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ALCAMQ13740 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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