Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL353626.1-201ENST00000613429 507 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 OPALIN-203ENST00000393871 3545 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ZNF493-201ENST00000339914 1665 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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