Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms