Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC091304.5-201ENST00000568969 158 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC061975.3-201ENST00000583209 244 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL035417.2-201ENST00000603887 796 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL136139.1-201ENST00000605568 222 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC022306.1-201ENST00000560489 1562 ntBASIC6.52□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CBWD6-203ENST00000456520 1608 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 MYL1-201ENST00000341685 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC012451.1-201ENST00000412312 357 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL157698.1-201ENST00000415190 1011 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AF274573.1-201ENST00000430535 494 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC093668.1-201ENST00000514917 911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC104009.1-201ENST00000528009 635 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.7 ms