Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC016831.3-201ENST00000446451 1723 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 LINC00652-202ENST00000454749 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 MED28P8-201ENST00000454831 521 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RNA5SP287-201ENST00000516358 103 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RN7SKP2-201ENST00000517003 319 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 SDHCP4-201ENST00000532834 510 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 MIR3137-201ENST00000577367 75 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC008770.1-209ENST00000591898 356 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL021918.1-201ENST00000603933 236 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 MIR7162-201ENST00000611134 69 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 PTPRT-211ENST00000618610 3230 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 BTK-210ENST00000621635 2767 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 TTN-AS1-265ENST00000627661 806 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC022784.6-204ENST00000520390 3442 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 LPAR1-202ENST00000374430 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 CACNB4-263ENST00000637779 1772 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL591543.1-202ENST00000642095 4149 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 ERAP1-202ENST00000443439 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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PTPREP23469 APP-209ENST00000440126 2846 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
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PTPREP23469 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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PTPREP23469 EPHA7-201ENST00000369297 1885 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PTPREP23469 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC009318.1-201ENST00000553105 2380 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
PTPREP23469 LINC01091-204ENST00000515769 2204 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PTPREP23469 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PTPREP23469 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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PTPREP23469 CARD17-201ENST00000375707 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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PTPREP23469 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC9□□□□□ -0.97
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PTPREP23469 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
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PTPREP23469 MYB-238ENST00000534044 1812 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PTPREP23469 P2RY14-201ENST00000309170 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PTPREP23469 SP140-203ENST00000392045 3246 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC090198.1-201ENST00000518639 2355 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PTPREP23469 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PTPREP23469 ZNF567-204ENST00000588311 2042 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
PTPREP23469 EYA1-202ENST00000340726 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PTPREP23469 ALG13-201ENST00000251943 3997 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
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