Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms