Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL353608.4-201ENST00000624487 1188 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 CCNC-204ENST00000482541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC069222.1-201ENST00000608028 3360 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 NSRP1-217ENST00000612959 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC087045.3-201ENST00000623046 2468 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP79-201ENST00000365193 109 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC002367.1-201ENST00000416765 405 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 TRBV30-201ENST00000417977 447 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC004160.2-201ENST00000425837 563 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RANP5-201ENST00000427731 655 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC00160-201ENST00000430635 693 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC244505.2-201ENST00000435089 759 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RPS10P3-201ENST00000439253 494 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL138930.1-201ENST00000446952 635 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL021154.1-201ENST00000451217 456 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC008026.1-201ENST00000460492 447 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL368P-201ENST00000473384 277 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL335P-201ENST00000482790 304 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 GAPDHP31-201ENST00000509325 1014 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC01411-204ENST00000510234 938 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 IGKV2-29-201ENST00000521304 372 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RAB30-205ENST00000527633 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 OR5F2P-201ENST00000532761 941 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC144548.1-201ENST00000549577 324 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL049780.1-201ENST00000554430 489 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC01588-213ENST00000557142 492 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC034105.2-201ENST00000561866 238 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL021918.1-201ENST00000603933 236 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 YTHDF2P1-201ENST00000604759 1271 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL356052.1-201ENST00000605764 376 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 MIR6872-201ENST00000612981 62 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL138924.1-201ENST00000629067 415 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 MFSD6-201ENST00000281416 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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